Jedinou školou v Partizánskom, ktorá poskytuje úplné stredné všeobecné vzdelanie, je gymnázium. História Gymnázia v Partizánskom sa začala školským rokom 1953/54, keď podľa nového Školského zákona vznikla jedenásťročná stredná škola z bývalej strednej školy doplnenej dvoma triedami denného štúdia a jednou triedou štúdia popri zamestnaní. Prvým riaditeľom JSŠ bol Emil Nandory, v školskom roku 1955/56 Arnold Mokoš. V júni 1956 mala škola prvých maturantov. Od septembra 1956 bol riaditeľom JSŠ Bemard Šeffer. Každoročným zvyšovaním poctu študentov pribúdali problémy s priestormi, čo čiastočne vyriešila prístavba JSŠ, dokončená v roku 1958. V septembri 1959 sa stal riaditeľom Jozef Gergel.
Veľkú zmenu v organizácii školy priniesol nový školský zákon z roku 1960, podľa ktorého vznikli základné deväťročné školy a tri najvyššie ročníky JSŠ sa zmenili na strednú všeobecnovzdelávaciu školu. SVŠ v Partizánskom sa od školského roku 1963/64 presťahovala do prístavby bývalej JSŠ, čím prišla o telocvičňu, odborné učebne i laboratóriá.
Od roku 1967 bol riaditeľom školy Jozef Kováč, ktorý mal zásluhu na rozšírení školy o prístavbu v priestore medzi ZDŠ a SVŠ. Tu sa postupne zrodili odborné učebne pre prírodovedné predmety. Podľa ďalšej reorganizácie stredného školstva sa od roku 1969 opäť zriadili gymnáziá. Od 1. septembra 1969 otvorilo Gymnázium v Partizánskom prvé dve triedy gymnaziálneho štúdia a posledné dve triedy SVŠ. Prvých maturantov malo gymnázium v roku 1973. Postupne rástla odborná úroveň školy zavádzaním nových predmetov, hlavne technického charakteru a cudzích jazykov. Dokončením ďalšej prístavby v roku 1983 sa vytvorili lepšie podmienky nielen pre klasické vyučovanie, ale aj pre moderné vyučovanie prírodovedných predmetov a jazykov.
Po smrti Jozefa Kováča bol v roku 1986 na niekoľko mesiacov poverený vedením školy Ján Budinský. V rokoch 1986 – 1990 bol riaditeľom školy Milan Krošlák. V týchto rokoch bola pripravená projektová dokumentácia na výstavbu telocvične.
V rokoch 1990 – 2004 bola riaditeľkou školy Helena Repková. V školskom roku 1992/93 vznikla prvá trieda osemročného štúdia so zameraním na cudzie jazyky. Neskôr pribudlo zameranie na programovanie.
V októbri 1993 bola otvorená nová telocvičňa, čím sa podstatne zvýšila kvalita vyučovania telesnej výchovy. Žiaci začali mať neporovnateľne lepšie podmienky pre telesnú výchovu a šport.
1.9.1994 vznikla pri gymnáziu trieda obchodnej akadémie. Gymnázium a obchodná akadémia pôsobili v budove gymnázia do roku 2001. Od septembra 2001 sa obchodná akadémia odčlenila od gymnázia a nasťahovala sa do priestorov Základnej školy na Nám. SNP.
Od roku 2004 je riaditeľom školy Tibor Csollár.